ポイントミューテーション

同時に複数のアミノ酸に対して変異可能です．
アミノ酸エディタで XXX と表示される異常アミノ酸に対しては変異できません．
内部では，おおよそ下のように処理しています．

  1. あらかじめ，置換基と同じ形式で側鎖を作成しておきます．この側鎖は，水素除去された状態です
  2. 変異のターゲットとなっているアミノ酸を Ala に変異します
  3. ターゲットの β-炭素に対して，置換基接続と同じ方法で側鎖を接続します

したがって，

必要に応じて水素付加/水素除去，エネルギー極小化等の処理をおこなってください．

手順

変異したいアミノ酸を選択

変異実行前

画像の分子は，モデルペプチドとして作成した Gly-Gly-Gly です．
アミノ酸エディタに Gly が 3 個並んでいます．

まず，変異したいアミノ酸を，アミノ酸エディタで選択状態にします．
これには，2 つの方法があります．

画像では，2 番めのグリシンが選択状態になっています．
複数のアミノ酸に対して同時に変異できます．

変異後のアミノ酸の種類を選択

変異ダイアログボックス

画像は，アミノ酸エディタの[選択を変異] ボタンをクリックすると表示されるダイアログボックスです．
変異させるべきアミノ酸の種類を選択してください．
画像では Pro を選択しています．

変異の実行

変異実行後

ダイアログボックスの [OK] ボタンをクリックすると，変異が実行されます．
画像は実行後の様子です．

変異後の処理例

コンフォメーション探索の結果

画像は，コンフォメーション探索で得られた構造です．
まず，垂直ツールバーの 水素付加[水素付加] ボタンをクリックして，Pro 側鎖に水素を付加しました．
次いで，メニューバーの [実験(_X)]-[コンフォメーション探索（全分子）] を実行しました．